Больше нет никаких преград! Пять великих наций идут на битву, как единое целое! Близится новая эра, и знаменосцем ее стал Объединенный Альянс Шиноби, сформированный ради двух первостепенных целей: защита джинчурики восьми и девяти хвостых биджу, а также окончательное и бесповоротное уничтожение преступной организации Акацуки. Бремя правления Альянсом легло на плечи преемника третьего Райкаге, его старшего сына, Эя, в то время как во главе многотысячной армии шиноби встал Гаара Пустынный. Кровопролитные сражение с боевыми силами Акацуки происходят ежечасно, полем битвы являются пять Великих стран, и преимущества в этой войне не постоянны. Используя технику Эдо Тенсей Якуши Кабуто призывает в этот бренный мир некогда павших воинов, дабы использовать их знаменитую силу против тех, кого они любили и тех, ради кого они и отдали свои бесценные жизни.

   Бывший ученик Орочимару ведет свою собственную игру, не считаясь с мнением Учихи Обито, который по прежнему вероломно выдает себя за Учиху Мадару. Тоби стремится заполучить оставшихся хвостатых демонов, дабы привести в исполнение свой грандиозный план «Око Луны», и ради этого он готов сделать все, что от него потребуется. Удивительно, но в одно и тоже время на поле битвы появляются двое некогда умерших представителей «проклятого клана»: Мадара и Итачи. Первый преследует вполне очевидные цели: в ближайшем будущем реализовать свой собственный вариант плана «Око Луны» и возродить чудовище Джуби на этой планете, используя в этих целях статую Еретика и семерку хвостатых демонов. Итачи же решает остановить «Нечестивое Воскрешение», ибо он более не подвластен контролю со стороны Кабуто, благодаря силе Котоамацуками, которую ему оставил лучший друг, Шисуи.

   Остаткам команды Саске, а именно Суйгецу и Джуго на одной из засекреченных баз Орочимару удаётся найти свиток, в котором описан процесс, позволяющий человеку манипулировать силой бога Смерти. С этой информацией они приходят к Учихе Саске, который решает, что ему необходима помощь своего бывшего учителя, Орочимару. Используя ДНК белой змеи, оставленной Кабуто, а также одного из многочисленных заключенных в северном убежище, «Ястреб» воскрешает змеиного саннина, принявшего их сторону в этой войне. Орочимару проводит особый ритуал, и используя силу Шинигами ему удаётся вернуть из нечестивого мира души четверых павших Хокаге:  легендарных братьев Сенджу, Сарутоби Хирузена и Намиказе Минато. Они - третья сторона в этой войне, не заинтересованная в победе своих оппонентов, а их цели, как и мотивы неизвестны. Они должны принять решение, от которого зависит их дальнейшая участь, а также судьба всего мира шиноби.

Основные моменты сюжета

Кабуто примкнул к Акацуки, вернув из небытия умерших шиноби. Однако, о их количестве и личностях известно немного. Сейчас силы объединенной армии шиноби ведут сражения только с многочисленными клонами белого Зецу, которые наступают на них по всем фронтам. Под угрозой нападения оказались страны и простые жители, поэтому армии Альянса пришлось разделиться, чтобы сдерживать их атаки. Положение Альянса заставило лидеров скрытых селений положиться на своих джинчуурики (многие из них не захвачены), которые сопровождают армию. Только однохвостый Шукаку и треххвостый Санби запечатаны в статуи Гедо Мазо, которая поставляет чакру для новых легионов белых Зецу. Большая часть континента в руках шиноби скрытых селений, но в бой еще не вступили воскрешенные Эдо Тенсеем и основные силы организации Акацуки. Об Орочимару ничего неизвестно, а отряд Саске скрылся из вида даже шиноби Корня. Где появятся отступники скрытого Листа остается только гадать.