Один из четырёх благородных кланов (Сенджу, Учиха, Хьюга, Узумаки) и единственный, который процветает по сей день. Клан Хьюга считается одним из старейших, так как образовался ещё до построения Скрытого Селения Листа. Так же известно, что Хьюги состоят в дальнем родстве с Учихами, как Сенджу с Узумаки.
Издавна клан поделён на две ветви, на главную и побочную. Члены главной ветви, правят кланом, в то время как побочная ветвь должна им прислуживать и защищать. Представители главной ветви владеют особой техникой джуиндзюцу, которой можно контролировать членов побочной ветви клана, а при желании даже убить. Печать наносится каждому Хьюге из побочной ветви клана в определённом возрасте, например, Неджи была нанесена печать в возрасте четырёх лет.
Через несколько лет, после окончания Третьей Мировой Войны, произошёл праздник в честь перемирия между Конохой и Кумо, в котором, представители клана Хьюга, приняли непосредственное участие, в честь трёхлетия первой дочери главы клана. У отца Хинаты был брат-близнец Хизаши, родившийся всего на несколько минут позже, чем его брат, это означало, что представителем главной ветви и главой клана станет Хиаши, а Хизаши со временем будет нанесено клеймо побочной ветви.
В ту же ночь, некто пробрался в особняк Хьюга и похитил наследницу клана. Однако, Хиаши вовремя заметил похитителя и убил его. Похитителем оказался один из шиноби Скрытого Облака, пришедший на празднование, судя по-всему, хотевший узнать секрет одного из трёх великих доудзюцу. Когда об этом инциденте узнали власти Конохи, они незамедлительно рассказали Кумо о том, что один из их людей пытался похитить Бьякуган, но Скрытое Облако опровергло это. Отношения между Скрытым Селение Листа заметно ухудшились с Кумогакуре, однако, выход из этого положения был. Кумо выдвинуло своё условие, взамен на мир, выдать им главу клана Хьюга. Однако, Скрытый Лист выдал не Хиаши, а Хизаши, который добровольно пожертвовал собой ради брата. С этих пор, сын Хизаши, по имени Неджи, возненавидел главную ветвь своего клана за то, что они так жестоко поступили с его отцом.
Хьюга Хината родилась ранней зимой в семье Хиаши и неизвестной представительницы клана Хьюга, а через шесть лет у девочки появилась младшая сестра, которую назвали Ханаби. С раннего детства на Хинату обрушилась большая ответственность, так как отец провозгласил её наследницей клана, к чему девочка была не готова из-за своей излишней доброты, собственно, за что ей и приходилось выслушивать частые упрёки отца. Со временем, куноичи уже перестала быть наследницей своего великого клана, так как её место заняла Ханаби, которая, по мнению Хиаши более талантливая. Уделяя основное время младшей дочери, отец фактически отказался заниматься тренировками старшей. Она не хотела сражаться, ей было страшно, страшно проиграть или невзначай причинить кому-нибудь боль, в принципе, именно из-за своих страхов и неуверенности, Хината часто проигрывала младшей сестре на тренировках. И после одного из таких проигрышей, старшая сестра Ханаби бежала по улице вся в слезах, никого и ничего не различая. Падение мороженого, как результат столкновения её и трех мальчиков. Мороженое принадлежало одному из них. Они начали к ней цепляться со всякими претензиями, а позже заметили, что она из клана Хьюга, плюс ко всему двоюродная сестра Неджи, а значит, нахальная и высокомерная, думающая, что она выше всех из-за того, что она представительница главной ветви. И мальчики даже не стали слушать слов девочки о том, что она не такая, как им кажется. Дочь Хиаши пыталась бежать, но один из мальчишек схватил её за рукав кимоно, вернув на место, с которого она хотела бежать. Мальчики снова окружили девочку и сообщили ей, что не отпустят её без извинений. Один из ребят ударил Хинату по голове так, что та упала на колени, другой же потребовал, чтобы она выдавила: "Мне очень жаль". Третий же требовал её искренности. И Хьюга подчинилась. Она сказала то, что они просили, однако, дети не поверили ей, требуя больше искренности в её словах. Один из них прижал голову куноичи к земле. Хината заплакала, выталкивая из себя извинения одно за другим. Мальчиков остановил Наруто Узумаки. Они начали говорить Наруто, что неужели он тот самый, которого все ненавидят и презирают? Узумаки ответил, что он не "тот" самый. Блондин ответил, что станет Хокаге и что этим ребятам стоит запомнить его имя. На это последовал еще более громкий смех, после чего завязалась драка. Один из детей ударил Наруто и тот упал, но всё равно встал и сложив ручные печати сделал неудачного теневого клона, над чем ребята опять посмеялись. Узумаки не стал терпеть насмешки и вновь ввязался в драку. В этот момент, до ушей девочки дошёл голос её наставника из клана, после чего дети разбежались. Он поинтересовался о состоянии здоровья у Хинаты, а увидев перед собой Наруто, незамедлительно увёл девочку.
Став немного постарше, Хината поступила в академию шиноби, а после окончания была распределена в одну команду с Абураме Шино и Инузукой Кибой, под руководством Юухи Куренай.
После того, как Куренай подала заявку на участие своей команды в чуунинском экзамене, вместе с Какаши и Асумой, по началу Хокаге пытался отговорить джоунинов, говоря о том, что дети ещё не готовы, но это не остановило Куренай, Какаши и Асума и они настояли на своём, после чего их команды официально зачислили на участие в экзамене.
Первый этап экзамена заключался в письменном задании, на котором, её посадили за одну парту с Наруто, чему куноичи очень обрадовалась. Сам тест был достаточно сложен для Хинаты, но она справилась. Но Наруто не справлялся, поэтому Хьюга предложила ему списать. Не смотря на все, он отказался. Вскоре Морино Ибики ввел дополнительный вопрос и поставил определенные рамки ответа на вопрос. Решившись на ответ, Хината осталась, почему и прошла первый этап экзамена.
Незаметно настала вторая часть экзамена. Вторая часть экзамена заключалась в том, чтобы добыть два свитка: небесный и земной, и за пять дней добраться до башни. После получения задания, командам нужно было подписать соглашение, что экзаменаторы не несут ответственность за их жизнь на время прохождения задания в Лесу Смерти. В этот момент Хината заметила Наруто, которому хотела дать свою целебную мазь, но запутавшись в своих мыслях, куноичи и не заметила, то как Узумаки пропал из поля зрения.
Команда № 8 удачно справилась с заданием, благополучно дойдя до башни, где их уже поджидали экзаменаторы и джоунины Конохи, Ото и Суны. Неожиданно для всех, в башне появился Гекко Хаяте, который сообщил о дополнительном этапе - бой один на один. Дополнительный этап объявили по той причине, что прошло больше половины участников экзамена, некоторых их которых надо бы отсеять.
Во время отборочных поединков, Киба проигрывает Наруто, Шино побеждает Канкуро, а вот Хинате выпадает бой против двоюродного брата. Еще до битвы царила напряженная атмосфера, так как на их фоне стояли конфликты внутри их клана. Больше всего Хината не хотела драться именно с Неджи, но всё таки выступила против него. Как обычно, она колебалась и была нерешительна, но всё же дралась, причём дралась так, как никогда раньше. Однако, победа всё-таки одержал Неджи. Куноичи, находившуюся после боя без сил и с серьезными внутренними повреждениями, унесли медики. Наверное, в какой-то степени было хорошо, что она была без сознания, так как не слышала всего, что начал говорить Неджи после поединка, в котором чуть не убил свою двоюродную сестру.
На третий этап экзамена Хината не прошла, из её команды прошёл только Шино, которого она пришла поддержать. Вскоре, куноичи стало известно о предстоящем бое Наруто против Неджи. Все вокруг говорили, что Узумаки прошёл в третий этап просто случайно и что с Неджи ему не потягаться. Но Хината знала, что это не так. Девочка с интересом наблюдала их бой, но неожиданно ей стало плохо и юную Хьюгу отправили в больницу. Куноичи не видела третий этап экзамена, но узнав о победе Наруто над Неджи, обрадовалась.
Далее, Неджи узнаёт правду о смерти своего отца, который по доброй воле отдал свою жизнь за брата, а Хиаши просит у мальчика прощение за то, что ему пришлось вытерпеть. После этого, юный Хьюга уже не питает былой ненависти к главной ветви клана.
В то время, когда Наруто тренировался у Джирайи, Хината тоже не сидела сложа руки. Она достигла ранга чуунина, много тренировалась, совершенствуя свои навыки и таки добилась определённых высот, доказав всем, что её напрасно недооценивали. А самое главное, что её отношения с двоюродным братом наладились. Более того, Неджи стал защитником Хинаты, поскольку, защита главной ветви клана и особенно защита Хинаты - такова была последняя воля Хизаши.
После возвращения уже натренированного Наруто с миссии, по спасению Казекаге, Хината наткнулась на него. Наткнулась и спряталась за забором. Да, она слышала, что он вернулся. Но не знала, что вот так запросто увидит его на улицах Скрытого Листа. Но когда парень её обнаружил, куноичи настолько удивилась, что упала в обморок. Очнувшись, до девушки не сразу дошло происходящее – казалось, что это был какой-то сон. Однако осознав свою довольно приятную реальность, Хьюга снова потеряла сознание, причиной тому был всё тот же Узумаки, полезший к ней с предложениями о вступлении в его команду. Девушка была на седьмом небе от счастья.
Далее, поступило известие о том, что Саске "убил" Орочимару, в связи с чем, команда номер №7 объединяется с командой №8. Хинате и сопровождающим её собакам Какаши, удаётся выйти на след младшего Учихи, но на пути обоих команд встаёт Тоби, который задерживает их. Затем обе команды узнают о бое Саске против старшего брата, при котором Итачи скончался. С помощью Бьякугана, Хината обнаруживает тело Итачи и Саске, который в то время находился рядом, однако, Тоби опережает шиноби Конохи, забрав младшего Учиху и труп его брата до их прихода на место, обнаруженное куноичи из клана Хьюга.
Во время нападения Пейна на Скрытый Лист, Хината и её друзья по команде, с ужасом наблюдает за тем, что творится. Однако, вскоре они разделились, так как Шино и Киба отправились искать своих родных. После того, как Коноха превратилась в руины, Хьюга остаётся жива, не получив серьёзных травм, потому что всё это время её защищал верный телохранитель Хьюга Ко. Он был серьёзно ранен, когда защищал свою родственницу. Девушка говорит Ко о том, что она найдёт ниндзя-медиков, которые могли бы ему помочь, но Ко отказывается от помощи, говоря о том, что ему важна лишь её безопасность. Затем, девушке стало известно, что Наруто в Конохе и сражается против Пейна один на один, при этом, попросив ни кого не вмешиваться в их бой. Узнав об этом, Хината спешит на помощь не смотря на все запреты Ко. Именно в этот момент Хината показывает свой характер. Девушка едва ли не впервые предстает перед Наруто, не краснея. Бесстрашная, она понимает, что Пейн намного сильнее её, но чувство благодарности, глубокое чувство уважения, привязанности, не дает ей шанса не попытаться хотя бы помочь Наруто. Та встреча с Пейном – переломный момент в жизни, а точнее в характере юной Хьюги. Если бы не эта схватка, вряд ли бы она смогла признаться Узумаки в своих чувствах, вряд ли бы она осознала бы в себе силы умереть ради дорогого человека. При встрече у девушки выходят наружу понимание чести, достоинства, благородства и патриотизма. Также в бою проявляется её рассудительность. Зная, что не сможет победить или хотя бы ранить тело Пейна, куноичи устремляется ломать колья дабы Наруто смог как минимум, двигаться без боли, а как максимум победить врага. В ходе поединка Хьюга "погибает", а разъярённый Наруто принимает форму Кьюби и продолжает сражение.
Вскоре, полу-живую куноичи находят члены команды №9, а чуть позже её лечит Сакура. Когда Хинате стало лучше, до неё дошла новость о том, что Наруто победил Пейна, а жители деревни, как и сама Коноха в целом, вернулись в первозданный вид. Джинчуурики девятихвостого становится настоящим героем Скрытого Листа.
[i]Во время Четвёртой Мировой Войны Шиноби, пять великих деревень образуют Альянс, а Хината и Неджи становятся частью второй дивизии.
Однажды, на девушку нападает Зецу, однако, ей на защиту вовремя приходит Наруто. Увидев его, Хьюга говорит о том, что считает себя слабой, но парень подбодрил её, сказав, что она очень сильная, вспоминая нападение Пейна. Почле чего, Узумаки уходит. Затем, Яманака Иноичи сообщает всем, что Наруто вступил в бой против Тоби, прося всех его поддержать.
Через некоторое время, Хината и прочие шиноби всех деревень, пребывают на поле боя Наруто, Гая, Какаши и Кира Би против Обито, Мадары и Джуби. Тоби отдаёт приказ десятихвостому о нападении на Наруто с помощью техники Мокутона, но Хината заслоняет Наруто, в то время как саму Хинату заслонил двоюродный брат. Неджи показал, что исполняет, то что обязан - защищает Хинату, жертвуя собой ради её жизни.